Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms