Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA5Q96PV4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA5Q96PV4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms