Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms