Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCHS1Q96JQ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms