Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF6Q96J87 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms