Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms