Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms