Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APIPQ96GX9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms