Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA7LQ96GN5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA7LQ96GN5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms