Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTV1Q96GA3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTV1Q96GA3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms