Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP36Q96G28 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP36Q96G28 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms