Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUB2Q96DC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms