Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms