Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCTD12Q96CX2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms