Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms