Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTSSAQ969W0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms