Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms