Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms