Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-CQ95604 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms