Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms