Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NCSTNQ92542 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCSTNQ92542 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms