Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29Q8TEQ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms