Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF3Q8TEJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF3Q8TEJ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms