Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PANK1Q8TE04 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PANK1Q8TE04 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK1Q8TE04 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PANK1Q8TE04 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms