Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP1Q8TDR0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms