Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GADD45GIP1Q8TAE8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1Q8TAE8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms