Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PJA1Q8NG27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PJA1Q8NG27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PJA1Q8NG27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms