Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HELBQ8NG08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms