Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms