Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM3Q8NE01 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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