Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms