Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N8P6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N8P6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N8P6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8N8P6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8N8P6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms