Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf53Q8N3J3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms