Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT1Q8IXI2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms