Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC6Q8IVU3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms