Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC50Q8IVM0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms