Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms