Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRX1Q86UT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRX1Q86UT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms