Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KRT27Q7Z3Y8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms