Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
STRCQ7RTU9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
STRCQ7RTU9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms