Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY3Q7L099 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY3Q7L099 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms