Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS12Q6ZW61 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms