Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms