Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX8Q6ZV50 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms