Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA0408Q6ZU52 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms