Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms