Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms