Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CASC2Q6XLA1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms