Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms