Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO4Q6UY18 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINGO4Q6UY18 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINGO4Q6UY18 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LINGO4Q6UY18 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINGO4Q6UY18 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO4Q6UY18 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO4Q6UY18 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO4Q6UY18 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms